استاد مرتضی مطهری ساعت ۲۲ و۲۰ دقیقه سه شنبه یازدهم اردیبهشت ۱۳۵۸ هنگامی که از یکی از جلسات فکری سیاسی بیرون آمده بود ، در محله دروازه شمیران، گلوله ای از سلاح جهل فرقان بیرون آمد و مستقیم بر مغز یکی از معلمان بزرگ انقلاب فرونشست،و با گلوله گروه جنایتکار فرقان به شهادت رسید.
معلمی که رهبر در رثای رفتنش گریستند و پیامی دردآلود صادر کردند. امام خمینی در این پیام مطهری را پاره تن خویش خواندند .
متن پیام به شرح ذیل است:
بسم اللَّه الرحمن الرحیم
انا للَّه و انا الیه راجعون
اینجانب به اسلام و اولیاى عظیم الشأن آن و به ملت اسلام و خصوص ملت مبارز ایران ضایعه أسف انگیز شهید بزرگوار و متفکر و فیلسوف و فقیه عالی مقام مرحوم آقاى حاج شیخ مرتضى مطهرى- قدس سره- را تسلیت و تبریک عرض مى کنم.
تسلیت در شهادت شخصیتى که عمر شریف و ارزنده خود را در راه اهداف مقدس اسلام صرف کرد و با کج روی ها و انحرافات مبارزه سرسختانه کرد، تسلیت در شهادت مردى که در اسلام شناسى و فنون مختلفه اسلام و قرآن کریم کم نظیر بود.
من فرزند بسیار عزیزى را از دست دادم و در سوگ او نشستم که از شخصیت هایى بود که حاصل عمرم محسوب مى شد.
در اسلام عزیز با شهادت این فرزند برومند و عالِم جاودان ثُلمه اى وارد شد که هیچ چیز جایگزین آن نیست.
و تبریک در داشتن این شخصیت هاى فداکار که در زندگى و پس از آن با جلوه خود نورافشانى کرده و مى کنند.
من در تربیت چنین فرزندانى که با شعاع فروزان خود مردگان را حیات مى بخشند و به ظلمت ها نور مى افشانند، به اسلام بزرگ، مربى انسانها و به امت اسلامى تبریک مى گویم.
من گرچه فرزند عزیزى را که پاره تنم بود از دست دادم لکن مفتخرم که چنین فرزندان فداکارى در اسلام وجود داشت و دارد.
مطهرى که در طهارت روح و قوّت ایمان و قدرت بیان کم نظیر بود، رفت و به ملأ اعلى پیوست، لکن بدخواهان بدانند که با رفتن او شخصیت اسلامى و علمى و فلسفى اش نمى رود . تروریستها نمى توانند شخصیت انسانى مردان اسلام را ترور کنند.
آنان بدانند که به خواست خداى توانا ملت ما با رفتن اشخاص بزرگ در مبارزه علیه فساد و استبداد و استعمار مصممتر مى شوند.
ملت ما راه خود را یافته و در قطع ریشه هاى گندیده رژیم سابق و طرفداران منحوس آن از پاى نمى نشیند.
اسلام عزیز با فداکارى و فدایى دادن عزیزان رشد نمود.
برنامه اسلام از عصر وحى تاکنون بر شهادت توأم با شهامت بوده. قتال در راه خدا و راه مستضعفین در رأس برنامه هاى اسلام است.
مَا لَکُم لاتُقاتِلونَ فِى سَبیلِ اللَّهِ وَالمُستَضعَفینَ مِنَ الرّجالِ وَالنّساءِ وَالولدانِ…آیه ۷۵ سوره نساء
اینان که شکست و مرگ خود را لمس نموده و با این رفتار غیرانسانى مى خواهند انتقام بگیرند یا به خیال خام خود مجاهدین در اسلام را بترسانند، بد گمان کرده اند.
از هر موى شهیدى از ما و از هر قطره خونى که به زمین مى ریزد، انسان هاى مصمم و مبارزى به وجود مى آید.
شما مگر تمام افراد ملت شجاع را ترور کنید والّا ترور فرد هر چه بزرگ باشد، براى اعاده چپاولگرى سودى ندارد. ملتى که با اعتماد به خداى بزرگ و براى احیاى اسلام بپا خاسته با این تلاش هاى مذبوحانه عقبگرد نمى کند.
ما براى فداکارى حاضر و براى شهادت در راه خدا مهیا هستیم .
اینجانب روز پنجشنبه سیزده اردیبهشت ۵۸ را براى بزرگداشت شخصیتى فداکار و مجاهد در راه اسلام و ملت، عزاى عمومى اعلام مى کنم و خودم در مدرسه فیضیه روز پنجشنبه و جمعه به سوگ مى نشینم.
از خداوند متعال براى آن فرزند عزیز اسلام رحمت و غفران و براى اسلام عزیز عظمت و عزت مسئلت مى نمایم.
سلام بر شهداى راه حق و آزادى .
روح اللَّه الموسوى الخمینى
(صحیفه امام، ج۷، ص: ۱۸۰)